Inštituti
1. Inštitut za zgodovino Cerkve
predstojnik: prof. dr. Janez Vodičar
2. Inštitut za filozofijo in družbeno etiko
predstojnik: red. prof. dr. Bojan Žalec
3. Inštitut za Sveto pismo, judovstvo in zgodnje krščanstvo
predstojnik: izr. prof. dr. Maria Carmela Palmisano
4. Inštitut za moralno teologijo in duhovna vprašanja sodobne kulture
predstojnik: doc. dr. Ivan Platovnjak
5. Inštitut za patristične študije
predstojnik: doc. dr. Miran Špelič
6. Inštitut za kanonskopravne vede
predstojnik: izr. prof. dr. Stanislav Slatinek
7. Inštitut za psihologijo in sociologijo religije ter zakonsko in družinsko terapijo
predstojnik: doc. dr. Igor Bahovec
8. Inštitut za aplikativno teologijo
predstojnik: doc. dr. Andrej Šegula
9. Inštitut Stanka Janežiča za dogmatično, osnovno in ekumensko teologijo ter religiologijo in dialog
predstojnik: doc. dr. Mari Jože Osredkar
10. Inštitut za bioetiko
predstojnik: prof. dr. Robert Petkovšek